Ya habia encontrado la respuesta.
Aqui va.
Para que se ejecuten los ELF al insertar un DVD/CD se necesita crear un archivo que se llama system.cnf
Lo cual lo debes de hacer.
Abres el bloc de notas y lo guardas como SYSTEM.CNF
[box title=TitleBox]
BOOT2 = cdrom0:\USBADVANCE.ELF;1
VER = 1.00
VMODE = NTSC
[/box]
El nombre del usbadvance tiene que ser el mismo que tiene el del system.cnf
De paso crea un dummy.
http://www.scenespain.net/foro/isekoteam/iso-dummy-(dummy-creator)-by-iseko/El dummy lo puedes hacer con cualquier capacidad que tu quieras.
y despues haces la imagen con el CDgenPs2, y lo quemas a la velocidad 4x o 2x